Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Col9a2Q07643 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Col9a2Q07643 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms