Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Col17a1Q07563 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Col17a1Q07563 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Col17a1Q07563 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms