Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cntn3Q07409 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cntn3Q07409 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms