Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Siah1bQ06985 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Siah1bQ06985 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms