Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prrx2Q06348 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms