Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Caprin2Q05A80 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Caprin2Q05A80 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms