Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PtprgQ05909 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PtprgQ05909 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtprgQ05909 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms