Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdk18Q04899 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms