Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms