Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sox9Q04887 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms