Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Emx2Q04744 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms