Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms