Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thbs2Q03350 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Thbs2Q03350 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms