Protein–RNA interactions for Protein: Q02819

Nucb1, Nucleobindin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb1Q02819 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nucb1Q02819 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nucb1Q02819 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nucb1Q02819 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nucb1Q02819 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nucb1Q02819 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nucb1Q02819 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nucb1Q02819 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nucb1Q02819 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nucb1Q02819 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nucb1Q02819 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nucb1Q02819 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nucb1Q02819 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms