Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gjb5Q02739 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gjb5Q02739 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms