Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nhlh1Q02576 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nhlh1Q02576 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms