Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nme2Q01768 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nme2Q01768 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms