Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mc1rQ01727 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Mc1rQ01727 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms