Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gbp1Q01514 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gbp1Q01514 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms