Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Col1a2Q01149 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col1a2Q01149 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms