Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SelpQ01102 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SelpQ01102 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SelpQ01102 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SelpQ01102 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SelpQ01102 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SelpQ01102 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SelpQ01102 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SelpQ01102 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SelpQ01102 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SelpQ01102 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SelpQ01102 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SelpQ01102 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SelpQ01102 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SelpQ01102 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SelpQ01102 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
SelpQ01102 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SelpQ01102 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SelpQ01102 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SelpQ01102 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SelpQ01102 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SelpQ01102 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SelpQ01102 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SelpQ01102 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SelpQ01102 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SelpQ01102 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SelpQ01102 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SelpQ01102 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SelpQ01102 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SelpQ01102 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SelpQ01102 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SelpQ01102 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SelpQ01102 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SelpQ01102 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SelpQ01102 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms