Protein–RNA interactions for Protein: Q00899

Yy1, Transcriptional repressor protein YY1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yy1Q00899 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Yy1Q00899 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Yy1Q00899 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.4 ms