Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
F8a1Q00558 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
F8a1Q00558 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
F8a1Q00558 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
F8a1Q00558 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
F8a1Q00558 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
F8a1Q00558 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
F8a1Q00558 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
F8a1Q00558 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
F8a1Q00558 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
F8a1Q00558 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
F8a1Q00558 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
F8a1Q00558 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
F8a1Q00558 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
F8a1Q00558 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
F8a1Q00558 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
F8a1Q00558 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
F8a1Q00558 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
F8a1Q00558 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
F8a1Q00558 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
F8a1Q00558 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
F8a1Q00558 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
F8a1Q00558 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
F8a1Q00558 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
F8a1Q00558 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
F8a1Q00558 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
F8a1Q00558 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
F8a1Q00558 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
F8a1Q00558 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
F8a1Q00558 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
F8a1Q00558 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
F8a1Q00558 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
F8a1Q00558 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
F8a1Q00558 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
F8a1Q00558 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
F8a1Q00558 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
F8a1Q00558 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
F8a1Q00558 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
F8a1Q00558 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
F8a1Q00558 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
F8a1Q00558 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
F8a1Q00558 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
F8a1Q00558 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
F8a1Q00558 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
F8a1Q00558 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
F8a1Q00558 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms