Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pax8Q00288 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms