Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cds1P98191 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cds1P98191 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cds1P98191 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cds1P98191 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cds1P98191 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cds1P98191 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cds1P98191 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cds1P98191 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cds1P98191 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cds1P98191 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cds1P98191 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cds1P98191 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cds1P98191 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cds1P98191 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cds1P98191 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cds1P98191 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cds1P98191 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cds1P98191 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cds1P98191 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cds1P98191 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cds1P98191 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cds1P98191 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cds1P98191 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cds1P98191 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cds1P98191 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cds1P98191 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cds1P98191 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cds1P98191 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms