Protein–RNA interactions for Protein: P98084

Apba2, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba2P98084 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Apba2P98084 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apba2P98084 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apba2P98084 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apba2P98084 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Apba2P98084 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Apba2P98084 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apba2P98084 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apba2P98084 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apba2P98084 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apba2P98084 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apba2P98084 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apba2P98084 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apba2P98084 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apba2P98084 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apba2P98084 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apba2P98084 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apba2P98084 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apba2P98084 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apba2P98084 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Apba2P98084 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apba2P98084 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apba2P98084 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apba2P98084 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apba2P98084 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apba2P98084 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Apba2P98084 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Apba2P98084 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Apba2P98084 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apba2P98084 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms