Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Scn1bP97952 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Scn1bP97952 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms