Protein–RNA interactions for Protein: P97946

Vegfd, Vascular endothelial growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfdP97946 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VegfdP97946 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfdP97946 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VegfdP97946 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VegfdP97946 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VegfdP97946 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms