Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pitx2P97474 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pitx2P97474 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitx2P97474 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitx2P97474 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitx2P97474 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitx2P97474 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitx2P97474 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitx2P97474 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitx2P97474 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitx2P97474 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitx2P97474 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitx2P97474 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitx2P97474 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitx2P97474 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitx2P97474 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitx2P97474 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitx2P97474 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitx2P97474 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitx2P97474 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitx2P97474 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitx2P97474 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitx2P97474 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pitx2P97474 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms