Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cmklr1P97468 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cmklr1P97468 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms