Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Smyd1P97443 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smyd1P97443 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Smyd1P97443 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smyd1P97443 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Smyd1P97443 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smyd1P97443 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smyd1P97443 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smyd1P97443 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smyd1P97443 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Smyd1P97443 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smyd1P97443 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smyd1P97443 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smyd1P97443 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smyd1P97443 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smyd1P97443 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smyd1P97443 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smyd1P97443 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smyd1P97443 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smyd1P97443 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smyd1P97443 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smyd1P97443 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smyd1P97443 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms