Protein–RNA interactions for Protein: P97436

Nkx3-1, Homeobox protein Nkx-3.1, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx3-1P97436 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx3-1P97436 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx3-1P97436 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx3-1P97436 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx3-1P97436 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx3-1P97436 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx3-1P97436 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx3-1P97436 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx3-1P97436 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx3-1P97436 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx3-1P97436 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx3-1P97436 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx3-1P97436 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx3-1P97436 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx3-1P97436 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms