Protein–RNA interactions for Protein: P97427

Crmp1, Dihydropyrimidinase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crmp1P97427 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crmp1P97427 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crmp1P97427 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crmp1P97427 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crmp1P97427 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crmp1P97427 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crmp1P97427 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crmp1P97427 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crmp1P97427 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crmp1P97427 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crmp1P97427 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crmp1P97427 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crmp1P97427 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crmp1P97427 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crmp1P97427 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crmp1P97427 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crmp1P97427 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crmp1P97427 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crmp1P97427 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crmp1P97427 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crmp1P97427 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crmp1P97427 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crmp1P97427 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crmp1P97427 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Crmp1P97427 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crmp1P97427 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crmp1P97427 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crmp1P97427 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Crmp1P97427 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crmp1P97427 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crmp1P97427 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crmp1P97427 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crmp1P97427 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crmp1P97427 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crmp1P97427 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crmp1P97427 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Crmp1P97427 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Crmp1P97427 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Crmp1P97427 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Crmp1P97427 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Crmp1P97427 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Crmp1P97427 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Crmp1P97427 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Crmp1P97427 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Crmp1P97427 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Crmp1P97427 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms