Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps45P97390 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps45P97390 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps45P97390 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps45P97390 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps45P97390 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps45P97390 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps45P97390 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps45P97390 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps45P97390 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps45P97390 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps45P97390 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vps45P97390 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms