Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Nkx2-3P97334 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nkx2-3P97334 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nkx2-3P97334 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms