Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mesp1P97309 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mesp1P97309 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms