Protein–RNA interactions for Protein: P86793

Ccl21c, C-C motif chemokine 21c, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21cP86793 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccl21cP86793 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Ccl21cP86793 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccl21cP86793 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccl21cP86793 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl21cP86793 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccl21cP86793 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl21cP86793 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccl21cP86793 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccl21cP86793 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccl21cP86793 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccl21cP86793 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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