Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vgll3P85442 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vgll3P85442 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms