Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbx1P82976 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbx1P82976 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbx1P82976 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbx1P82976 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbx1P82976 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbx1P82976 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbx1P82976 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbx1P82976 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbx1P82976 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbx1P82976 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbx1P82976 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbx1P82976 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbx1P82976 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbx1P82976 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbx1P82976 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbx1P82976 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbx1P82976 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbx1P82976 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbx1P82976 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbx1P82976 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbx1P82976 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gbx1P82976 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gbx1P82976 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms