Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Irx3P81067 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Irx3P81067 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irx3P81067 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irx3P81067 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irx3P81067 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irx3P81067 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms