Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Otx2P80206 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otx2P80206 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otx2P80206 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otx2P80206 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otx2P80206 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Otx2P80206 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otx2P80206 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otx2P80206 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otx2P80206 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Otx2P80206 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otx2P80206 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms