Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad50P70388 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad50P70388 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rad50P70388 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rad50P70388 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rad50P70388 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rad50P70388 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms