Protein–RNA interactions for Protein: P70314

Pitx1, Pituitary homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx1P70314 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pitx1P70314 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pitx1P70314 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pitx1P70314 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pitx1P70314 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pitx1P70314 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pitx1P70314 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pitx1P70314 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pitx1P70314 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pitx1P70314 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pitx1P70314 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pitx1P70314 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pitx1P70314 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pitx1P70314 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pitx1P70314 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pitx1P70314 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pitx1P70314 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pitx1P70314 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pitx1P70314 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pitx1P70314 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pitx1P70314 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pitx1P70314 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pitx1P70314 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pitx1P70314 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pitx1P70314 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pitx1P70314 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pitx1P70314 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pitx1P70314 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pitx1P70314 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pitx1P70314 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pitx1P70314 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pitx1P70314 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pitx1P70314 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pitx1P70314 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pitx1P70314 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pitx1P70314 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pitx1P70314 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pitx1P70314 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pitx1P70314 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms