Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vamp7P70280 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms