Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Surf6P70279 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Surf6P70279 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf6P70279 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf6P70279 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Surf6P70279 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Surf6P70279 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Surf6P70279 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Surf6P70279 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Surf6P70279 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Surf6P70279 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf6P70279 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf6P70279 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf6P70279 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf6P70279 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf6P70279 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf6P70279 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf6P70279 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf6P70279 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf6P70279 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf6P70279 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf6P70279 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf6P70279 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf6P70279 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf6P70279 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf6P70279 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf6P70279 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf6P70279 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Surf6P70279 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Surf6P70279 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms