Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NfixP70257 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NfixP70257 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NfixP70257 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NfixP70257 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NfixP70257 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NfixP70257 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NfixP70257 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NfixP70257 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NfixP70257 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NfixP70257 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NfixP70257 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NfixP70257 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NfixP70257 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NfixP70257 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NfixP70257 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NfixP70257 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NfixP70257 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NfixP70257 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NfixP70257 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NfixP70257 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NfixP70257 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NfixP70257 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NfixP70257 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NfixP70257 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NfixP70257 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NfixP70257 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NfixP70257 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NfixP70257 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NfixP70257 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NfixP70257 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NfixP70257 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NfixP70257 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NfixP70257 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NfixP70257 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NfixP70257 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NfixP70257 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NfixP70257 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NfixP70257 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NfixP70257 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NfixP70257 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NfixP70257 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NfixP70257 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NfixP70257 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NfixP70257 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NfixP70257 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NfixP70257 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NfixP70257 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NfixP70257 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NfixP70257 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NfixP70257 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NfixP70257 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NfixP70257 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NfixP70257 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NfixP70257 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NfixP70257 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NfixP70257 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NfixP70257 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NfixP70257 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NfixP70257 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NfixP70257 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NfixP70257 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NfixP70257 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NfixP70257 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NfixP70257 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfixP70257 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfixP70257 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfixP70257 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfixP70257 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfixP70257 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfixP70257 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NfixP70257 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfixP70257 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfixP70257 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfixP70257 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfixP70257 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfixP70257 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfixP70257 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NfixP70257 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfixP70257 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfixP70257 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfixP70257 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfixP70257 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfixP70257 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfixP70257 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NfixP70257 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NfixP70257 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NfixP70257 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NfixP70257 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NfixP70257 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NfixP70257 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NfixP70257 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NfixP70257 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NfixP70257 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NfixP70257 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NfixP70257 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NfixP70257 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NfixP70257 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NfixP70257 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NfixP70257 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms