Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd13P70217 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxd13P70217 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms