Protein–RNA interactions for Protein: P63260

Actg1, Actin, cytoplasmic 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actg1P63260 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actg1P63260 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actg1P63260 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actg1P63260 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actg1P63260 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actg1P63260 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actg1P63260 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actg1P63260 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actg1P63260 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actg1P63260 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actg1P63260 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actg1P63260 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Actg1P63260 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms