Protein–RNA interactions for Protein: P63163

Snrpn, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpnP63163 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SnrpnP63163 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms