Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtnP63089 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtnP63089 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PtnP63089 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtnP63089 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtnP63089 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtnP63089 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtnP63089 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtnP63089 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtnP63089 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtnP63089 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtnP63089 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtnP63089 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtnP63089 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtnP63089 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtnP63089 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtnP63089 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtnP63089 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtnP63089 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtnP63089 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtnP63089 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtnP63089 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtnP63089 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtnP63089 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtnP63089 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtnP63089 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtnP63089 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtnP63089 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtnP63089 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtnP63089 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtnP63089 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtnP63089 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtnP63089 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtnP63089 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtnP63089 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtnP63089 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtnP63089 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PtnP63089 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtnP63089 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtnP63089 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtnP63089 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtnP63089 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtnP63089 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtnP63089 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtnP63089 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtnP63089 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtnP63089 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtnP63089 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtnP63089 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtnP63089 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtnP63089 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtnP63089 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtnP63089 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtnP63089 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtnP63089 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtnP63089 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtnP63089 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtnP63089 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtnP63089 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtnP63089 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtnP63089 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtnP63089 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtnP63089 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtnP63089 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtnP63089 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtnP63089 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtnP63089 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtnP63089 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtnP63089 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtnP63089 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtnP63089 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtnP63089 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtnP63089 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtnP63089 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtnP63089 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtnP63089 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtnP63089 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtnP63089 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtnP63089 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtnP63089 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtnP63089 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtnP63089 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtnP63089 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtnP63089 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtnP63089 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtnP63089 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtnP63089 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtnP63089 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtnP63089 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtnP63089 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtnP63089 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtnP63089 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtnP63089 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtnP63089 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtnP63089 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtnP63089 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtnP63089 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtnP63089 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtnP63089 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtnP63089 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms